Causa
Quando for emitida uma NF-e com Finalidade de Emissão (Campo: ide / finNFe - ID: B25) igual a "2 - NF-e complementar" e não for informado o Grupo de Documento Fiscal Referenciado (Campo: NFref - ID: BA01) com uma NF-e, NFC-e ou NF modelo 1, será retornado a rejeição "254 - NF-e complementar não possui NF referenciada".
Exemplo:
Foi emitida uma NF-e com Finalidade de Emissão "2 - NF-e complementar" e não foi informado a NF referenciada (NF-e). Nessa situação, a NF-e será rejeitada pelo motivo 254.
Como Resolver
Ver no manual o item Como referenciar um nota fiscal, em Perguntas frequentes.
Feita a correção, basta reenviar a NF-e para processamento.
Referência
Manual de Orientação do Contribuinte - http://www.nfe.fazenda.gov.br/portal/exibirArquivo.aspx?conteudo=9hd38oni4Nc=